五帝时代，人类逐渐走向成熟，原始诸神却消亡了 。传承于原始神成为世界管理者的众神，建立了天界、地界和初步的管理秩序 。需要指出的是，众神存在一定的分工，有些神专事于对自然界运行规律、修炼和消亡的研究工作，如太上老君、元始天尊等，没有参与人类的教导和管理秩序的建立工作，因而在上古神话中几乎没有出现祂们的身影 。然而，恰恰是祂们通过长期的研究探索，掌握了最“先进”的“技术”，最终成为推动神话世界发展的决定性人物 。3、人类自治与三界秩序的最终完成
人类本来就是因为要协助神实施改造世界的基础工作而受到众神教导的，神一直在等待人类可以独立承担工作 。舜帝时期，发生了大洪水，这可能源于自然界的剧烈变化，可能是神进行某些试验失败的产物，也可能就是神故意为之而对万物的一次考验 。不管哪一种说法，最终人类在禹带领下通过了考验，走向了成熟 。于是神决定结束对人的直接领导，由人类自治，自我发展 。最后一位直接管理人类的神禹承担了过渡性工作，最终将帝位传于纯人类属性的儿子启，由启建立了人类自治时代的开端——夏朝 。
从原始神到这个时期的神，尚未找到维持自身稳定，避免消亡的成熟方法 。建立天界虽然可以减缓消亡的过程，但只是治标不治本的办法 。为此，以太上老君、元始天尊、通天教主为主要代表的“研究派”诸神一直进行着艰苦的探索，最后选定万物中资质最好（精神力最高）的人类为试验对象，教导凡人修炼成仙 。这种方法也得到官方法定认可并建立了仙籍加以管理 。也有部分神尝试以动植物为试验对象的，于是就出现了各种妖、精、怪 。由于这种方法没有取得官方许可，所以妖、精、怪的地位不及仙，而且屡屡成为官方打击的对象 。
太上老君、元始天尊和通天教主分别以自己的方式教导人类弟子修仙，形成了人教、阐教和截教，尤以后两者更具规模化 。到了商纣时期，三神见时机成熟，同时也实在因为天界严重缺神，便借纣王开罪女娲娘娘之机以“兴周灭商”为考题，举办了一场大型天庭公务员考试这场考试办得惊天动地，最后为三界管理机构补足了各缺职，三界秩序最终完成 。（详见《封神演义》）
这场考试，阐教成绩最好，元始天尊非常满意，宣布退休，后世神话中鲜有登场 。截教成绩最差，通天教主十分介怀，因此与两位师兄心生芥蒂，不承认这套管理秩序，成为天庭的主要反对派 。后世神话中策划过几次颠覆行动 。
太上老君继续从事研究探索工作，最后决定转世人间亲自走一遍修仙过程以期突破最后的难关 。祂转世为春秋时期的老子，经过一番参修，终于掌握了人类修仙的成熟方法并流传于世，是为道教 。老子觉醒后重新成为太上老君（此时祂的归类严格讲是仙），祂也找到了一种避免神仙消亡的方法——仙丹法 。所以返回天庭后，太上老君的主要工作就是炼制仙丹以帮助众神克服消亡 。当然，祂同时兼天庭顾问 。
还有部分神（也可能是仙），如接引道人和准提道人，主要活动在西天，创立早期的西方教 。在封神考试结束后，重返西天，也像太上老君一样转世人界，探索修仙和不灭的方法 。接引道人转世为乔达摩•悉达多，经过苦修，大彻大悟、参透天地万物而得以觉醒为如来佛祖 。如来创建了另一套修炼方法流传于世，是为佛教 。祂引导了转世为人的慈航道人、普贤真人等觉醒，成为了观音、普贤等诸菩萨 。（《观音传》讲的就是转世为人的慈航道人如何觉醒为观音菩萨的故事）