1、开天辟地及创造万物：
起初世界，阴阳二气的相互作用虽然形成了五元素，但没有出现高级组合形态，五元素始终处在瞬息万变的相生相克中；阴阳二气虽能偶然积聚，但因无对应的物质载体维持稳定而迅速自散 。整个世界处于及生及灭的强烈动态变化中，这就是混沌状态 。然而，偶然形成的某些高积聚态的阴阳二气，对周边施放的力场偶然将周围的五元素组合成某种实物载体，进而得到稳定而形成灵气，最终觉醒成为原始神 。从概率论角度看，这是一个必然会发生的概率事件 。这就解释了为什么在混沌状态下会出现原始神 。
这一时期可能会出现多个高积聚态灵气，但谁是第一个觉醒的原始神，有多种说法，只要依照前文的基本前提都可以得到合理的解释 。本文取创始元灵说，即最早觉醒的是创始元灵，祂引导了四个灵气觉醒，分别为鸿筠、混鲲、女娲、陆压 。盘古是第一个勇于改变混沌状态的原始神，祂觉醒后，造了一把斧，开天辟地，并且为了防止天地复合而用尽全力，最终其实物载体分崩为名山大川 。但盘古的元神并没有完全散尽，有一部分得以转世而成为后世的元始天尊 。元始天尊受鸿筠老祖引导觉醒，以其为师；师兄为太上老君（很可能就是创始元灵的转世），师弟为通天教主 。
盘古虽然开了天地，但世界很不稳定，于是先后觉醒的原始诸神开始研究使世界稳定运行的方法 。有些原始神采用的方法是利用五元素制造实物载体并积聚灵气于其上，创造物种，用于改造和稳定世界 。后世描述的大部分原始诸神之所以奇形怪状，原因正是祂们依照自身部位特点创造了某类物种，而人类却以这些物种反过来描述原始神的身体部位 。一些成功的作品得以生息繁衍留存于世，一些失败的作品最终被淘汰，还有一些少量的特殊物种后来修炼成神或是成为神仙的宠物而绝迹于人界了 。还有一些自然形成的具有高积聚态灵气的单位没有觉醒成原始神，而是留于后世，成为超级法宝 。
在所有创造品中，女娲创造的人类无疑是最为成功的一个 。经过考察，众原始神一致同意以人类作为维持自然界运行的助手，辅助自己完成一些最基本的改造世界的工作 。为此，众原始神将自己研究的一些改造自然的方法教授给人类，人类因此学会了用火、使用工具、种植、饲养，人类灵气的精神力也得到提高，有了语言、文字，成为自然界之首 。众原始神转世，也多以人类为实物载体 。
自开天辟地而始的创世过程是一个在动荡环境下的艰难的探索过程，有成功也有失败 。原始诸神由于灵气的消耗、本身的不稳定性（载体为偶然创造的，具有不完善性）及环境影响，尚不能很好的克服载体的基础物性，一部分元神与载体俱灭，彻底消亡了；一部分在实物载体消亡后，部分元神得以转世而成为后世的神仙 。（这就能很好的解释某些神话人物的起源传承，使前后在逻辑上得到统一）2、五帝传承及三界形成
开始时各原始神按照自己的方式方法教导某一地域的人类并带领他们改造世界，因而各地域的上古人类都有自己膜拜供奉的始祖 。（这一点可以使各地域的神话传说得到逻辑上的统一）后来由于权利之争最终导致上古诸神大战 。最后黄帝得到诸神认可，成为总负责，为五帝中的第一帝 。这个时期的原始神，主要是通过使人类感孕产下子嗣而得到灵气的传承，还不是后世严格意义上的转世 。因而其子嗣仍然具有某些原始神的特点，如奇形怪状的非纯人类载体 。传承的灵气的品性及法力也有变化 。黄帝消亡后，其孙颛顼成为第二帝 。炎帝后代共工争夺帝位失败，怒撞不周山，导致天裂 。女娲炼五色石补天，后因材料不足，便以自身载体填补最后一个裂缝 。原始神女娲因而消亡，但其部分元神转世成后世的女娲娘娘，因造人和补天的功绩而得到极高的尊重，但法力大不如前 。这一时期，原始神基本消亡殆尽，取代祂们继续管理世界的就是神了 。第三帝帝喾统领天下时，专事研究工作的神们取得两大成果，一是掌握了减缓自身实物载体自然消亡过程的方法，使寿命大大延长；二是掌握了完善的灵气转世方法 。于是在帝喾时代，诸神建立了天界用于延缓寿命（因而有天上一日地上一年的说法），建立了地界用于处理灵气的转世问题 。帝喾也从此移居于天界，成为第一任天帝统领三界 。人界管理权禅位于尧，是为第四帝 。尧让位于舜，是为第五帝 。