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亚当和基督
第二个问题：倘若《圣经》的说法与笛卡尔、牛顿的新科学相符 ， 或者看起来一样的话 ， 能否认为《圣经》的作者们知晓自然的秘密？摩西打算向其同时代人传达多少科学信息？是否他说的所有细节都是正确的？类似的问题也同样存在于佛教 。现在不少佛教信仰的捍卫者声称 ， 佛经里早就有“佛观一钵水 ， 八万四千虫” ， 早就知道细菌的存在 ， 只是时人理解不了细菌 ， 佛教只能以一种比较迁就的方式作出调整 。《圣经》同样依照最初受众的心智能力 ， 调适（accommodate）了科学知识 ， 用比较朴素的说法将它们传达给世人 。于是 ， 凭借先进的科学 ， 后人就可以辨识特定经文的隐秘含义 ， 重建摩西的真正想法 。许多十七世纪的学者尝试按照笛卡尔或牛顿的体系重读《创世记》 ， 意图从对自然之书的发现揭示《圣经》中被忽视的科学宝藏 。笛卡尔派学者亨利·摩尔（Henry More ， 1614-1687）第一次尝试将笛卡尔的宇宙起源论和神圣史（即摩西叙述的创世史）结合起来 ， 认为当地球过于靠近太阳时 ， 世界末日就会最终来临 。他把世界末日拉回到了历史的时间之中 ， 作为历史的一刻 。
当时产生了不少著名的“地球理论”著作 。所谓“地球理论”并非简单的关于地球演化的理论 ， 而是特指把地球的变化与《圣经》的神圣史结合起来的特殊题材 。这些书都认为地球中心的火把地下水加热 ， 使之冲破地壳 ， 引发了大洪水 ， 淹没了地球 。按照它们的计算 ， 大洪水比下了四十天的雨还要多 ， 这些水只能从地下来 。托马斯·伯内特（Thomas Burnet）的《地球的神圣理论》（Telluris Theoria Sacra ， 1681）里有一幅插图 ， 是个很好的例子：图的最上方是基督 ， 主宰着地球从出生到毁灭的整个过程 。地球由一个黑暗的星体苏醒 ， 起初并不完美 ， 非常光滑 ， 后来大洪水令地壳破裂 ， 才有了山峦叠嶂 ， 千沟万壑 ， 最后是末日大火烧毁了整个星球……在地球理论中 ， 世界末日同样被纳入了历史时间的范畴 。

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《地球的神圣理论》插图
与此同时 ， 一些人开始在物理宇宙中寻找天堂和地狱的可能位置——是在慧星？太阳？还是地心？还有人试图为人体的复活、净化和神化寻求科学解释 。他们认为有三种“自然”过程可以作为人死后身体变化的可能机制：一是炼金术 ， 犹如贱金属转变为黄金的质的飞跃；另外两种是种子的萌发和昆虫的变态 ， 比如化茧成蝶就好像一个全新的开始 。这些自然现象的变化机制被用来解释《圣经》中所说的人的身体变化 。
上述这些综合代表了科学与宗教关系史上的一个重要阶段：《圣经》的字面真理与新科学的理论真理被认为是完全一致的 。自然知识可以帮助诠释《圣经》 ， 《圣经》知识也可以帮助理解自然 。这是科学与宗教关系史上最好的时光 ， 双方水乳交融 ， 不分彼此 。但冲突的种子也就此埋下：就像自然与超自然区分被打破一样 ， 当科学和宗教处于同一个层面时 ， 战争爆发指日可待 。

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