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美龄居保护意义南麂列岛国家级海洋保护区处于台湾暖流和江浙沿岸流的交汇处，生态环境独特，生物种类多样，生物区系複杂以及由此构成的生态系统完整性决定了该保护区具有全球意义的保护价值 。南麂列岛国家级海洋自然保护区的建立，有利于对海洋贝藻类群落、海洋性鸟类及名贵海洋鱼类等海洋生物栖息地的保护 。南麂列岛国家级海洋自然保护区的建立，有利于保护当地自然和人文景观，有利于社会的可持续发展 。
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