武宗让他留守京师 ， 京师内外的人都重视他 ， 依靠他 。但是 ， 由于他曾和宁王朱宸濠有交往 ， 所以朱宸濠谋反失败后 ， 武宗虽然因为萧敬年老 ， 不予逮捕 ， 但仍罚了他的钱 ， 并把他罢免.正德十六年 ， 武宗病逝 ， 无子 ， 由藩王朱厚入承帝位 ， 就是世宗 。世宗因为萧敬德高望重 ， 又熟悉宫廷各种事务和礼制 ， 所以特地诏令他入宫 ， 管理机务 。世宗到南北郊祭祀 ， 逢年、节、四时用酒食祭拜太庙 ， 视察国子监 ， 耕籍田的时候 ， 都由萧敬侍从 。
这时萧敬已经是八十五岁高龄了 ， 但仍然头脑清楚 ， 精力充沛 ， 在宫中进退周旋 ， 行步不差尺寸 。但是弹劾萧敬的官员亦不少 ， 如张原在《请逐太监萧敬疏》中 ， 说他“囊橐积资不下一二十万” 。毛伯温弹劾他阴谋援助已被判死罪的宦官张锐、张忠等 ， 请亦判他死刑 。萧敬请求补监局工匠一千五百人 ， 兵部尚书彭泽坚决反对 ， 世宗亦接受了彭泽的意见 ， 等等 。但是 ， 这些情况在大学士杨一清给他写的墓表中 ， 都没有反映 。
嘉靖元年 ， 萧敬屡受廷臣弹劾 ， 请求告老退休 。世宗准了他的请求 ， 并念他过去的功劳 ， 除年俸外 ， 每月再加米十石;每年拨人夫十人给他役使;逢年过节都像过去一样赐给时令食品 。这样的待遇 ， 比退休的内阁大学士还要好 ， 也是以前的宦官从未得到的 。嘉靖七年 ， 萧敬在宫外私宅病逝 。世宗命司礼太监赖义负责丧事的礼仪 ， 御马监太监韩锡等综合办理有关丧葬的事 。谕祭三坛 ， 赐新钞三万缗 。敕命要切实办好棺木、造墓、建享堂等事 。皇太后赐给白金一百两 ， 文绮四表里 。大学士翟銮为他撰墓志铭 ， 杨一清为他写墓表 。萧敬悟性很好 ， 小时读书就能明道理 ， 后来更利用宫中藏书丰富的有利条件 ， 博览典籍 ， 故学识丰富 。他写的诗品格清高飘逸 ， 没有华丽的语句 。他的书法开始时是临摹欧帖 ， 后来转为沈体 ， 尤其爱好草书 。
他历侍六个皇帝 ， 仕途也有起伏曲折 ， 但亦四次任司礼监秉笔太监 ， 四次任司礼监掌印太监 ， 前后长达五十年 。他名下的宦官有百人之多 。他对待士人温和恭敬 ， 杨一清在内阁时 ， 屡次因为公事有接触 ， 有时杨一清反驳武宗的意见 ， 语中对萧敬亦不是那么客气 ， 但萧敬并不介意 。萧敬虽然也干了些违规的事 ， 但还不至揽权谋利 ， 拉帮结派 。
他不满其他权宦的敛财 ， 虽然在皇帝身边几十年 ， 但第宅始终还是原来那一间 ， 没有为自己添置什么产业 。退休后更是甘于林下之乐 ， 杜门不出 ， 绝口不谈时事 ， 只和相知的来客赋诗、鼓琴、下棋 。垂危时 ， 告诫他的侄子、侄孙说：“做臣子的人 ， 最重要的是不要欺骗 。”其他什么话也没有说 。像他这样不敛财 ， 不滥用权力的宦官 ， 在明中叶后是比较难得的 。萧敬的侄孙萧是锦衣卫指挥使 ， 从孙萧韶、萧歆都是进士 ， 还有几个任锦衣卫 。
【揭秘：明朝大太监萧敬是靠什么获五朝皇帝信任？】