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禾草秆鏽病，由禾柄鏽菌导致的，植株地上部分均可受侵染，而以茎秆和叶鞘发生最重 。病部出现较大的、长圆形疱斑，以后此处的寄主表皮破裂，露出粉末状孢子堆，初为黄褐色，即夏孢子堆 。禾草冠鏽病：病菌主要为害叶片，好侵染其它地上器官 。夏孢子堆叶两面生，初为黄色橙褐色疱斑，而且后寄主表皮破裂露出桔黄色粉末状夏孢子堆 。严重时病斑汇合至病叶枯死 。生长后期，衰老叶片背面出现黑褐色稍隆起的丘斑，即病菌的冬孢子堆 。禾草雀麦花叶病毒病：病株叶片上出现淡绿色或黄色条纹，病株矮化，刈割后再生迟缓 。禾草条鏽病：地上部分均可受害，但主要发生于叶片 。夏孢子堆小形，鲜黄色，不穿透叶片，沿叶脉排列成虚线状（“针脚”状），初为小丘斑状，后寄主表皮破裂露出粉末状夏孢子堆 。冬孢子堆主要生于叶背面，近黑色，表皮不破裂，形状与排列形式类似夏孢子堆 。常见虫害扁穗冰草常见害虫有亚洲飞蝗、宽须蚁蝗、小翅雏蝗、狭翅雏蝗、西伯利亚蝗、草原毛虫类、粘虫、麦长管蚜、麦二叉蚜、禾缢管蚜、义大利蝗、无网长管蚜、蛴螬、蝼蛄类、金针虫类、小地老虎、黄地老虎、大地老虎、白边地老虎、大垫尖翅蝗、麦穗夜蛾、跳甲类、叶蝉类、青稞穗蝇 。