蓝玉处死七个月以后，朱元璋似乎意识到“胡蓝二党诛杀过当”，下了一道诏书：“自今胡党、蓝党概赦不问 。”其实杀了四万多人，功臣宿将死得差不多了，“概赦不问”云云不过是一句显示皇恩浩荡的废话而已 。
胡蓝党案的后果是严重的，洪武三十年正月，朱元璋任命长兴侯耿炳文为征西将军，武定侯郭英为征西副将，坐镇西北边防 。史家评论道：“诸勋臣坐胡蓝二党，诛戮且尽，(耿)炳文以开国功臣榜列其名”，“是时，元功宿将无出其右者”;“上(指朱元璋)自起兵以来，存者仅(耿)炳文与(郭)英二人，而(耿)炳文亦年逾六十矣” 。不久，燕王朱棣打着“清君侧”的幌子，发兵南下时，建文帝无将可派，不得不命年迈的长兴侯耿炳文率军出征，败局已定 。

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