绍圣元年 ， 章惇执政 ， 重用新派人士 ， 改差役制为雇役制 ， 逐步恢复王安石变法的各项政策 ， 诸如免疫法、保田法、青苗法等等 。后来更是总编《常平、免役敕令》一书 ， 颁行天下之后 ， 熙宁新法基本恢复 。
当政之时 ， 章惇多次打压旧党人氏 ， 旧党官员或夺权罢职 ， 或外放贬谪 ， 轻重处理大小不一 ， 后来章惇甚至想要将两后废除 。
宋哲宗晚年 ， 因为无子嗣 ， 所以后继之人成为重大问题 。当时朝中有人推举端王 ， 也就是后来的宋徽宗作为皇位继承人 ， 但是章惇却极力反对 。等到宋徽宗继位之后 ， 章惇屡屡被贬 ， 最后被贬为为雷州司户参军 。此后多次改任 ， 差不多都是这种不值一提的地方小官 ， 毫无实权 。
崇宁四年 ， 章惇去世 ， 享年七十岁 ， 政和年间 ， 赠观文殿大学士、太师 ， 追封魏国公 。绍兴年间再次被贬 ， 子孙不仕朝 。

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